Институт пути, строительства и сооружений образован в 1998 году путем слияния старейших факультетов РУТ (МИИТ) строительного профиля. Это факультеты «Строительство железных дорог», «Мосты и тоннели», на которых с 1896 велась подготовка инженеров-путейцев и мостовиков, и факультет «Промышленное и гражданское строительство», созданный в 50-е годы XX века в связи с бурным ростом жилищного строительства.
На момент объединения факультетов в один институт там велась подготовка по специальностям «Строительство железных дорог, путь и путевое хозяйство», «Мосты и транспортные тоннели», «Промышленное и гражданское строительство», «Системы автоматизированного проектирования», «Автомобильные дороги и аэродромы», «Экспертиза управления недвижимостью», «Кадастры недвижимости», «Управление качеством в производственно — технологических системах», «Инженерный менеджмент в транспортном строительстве».